프로티나는 독자 개발한 SPID(Single molecule Protein Interaction Detection) 플랫폼을 기반으로 단백질 간 상호작용(PPI)을 단일분자 수준에서 고속·대량 분석하는 PPI 빅데이터 전문 기업임. 주력 제품은 다국적 제약사의 임상 효율화를 지원하는 PPI 바이오마커 개발 솔루션 PPI PathFinder®와 항체 디자인·신약개발 솔루션 PPI Landscape®이며, SPID 플랫폼 시스템(Pi-Chip, Pi-View, Pi-InSight) 장비도 판매함.
2025년 매출 구성은 SPID Platform Systems 장비 판매(약 20.7억원, 70%)가 최대 비중을 차지하였으며, PPI PathFinder® 서비스(약 6.3억원, 21%), PPI Landscape® 서비스(약 2.5억원, 8%) 순으로 구성됨. 2025년 내수 비중이 전체의 약 90%로 높아진 반면, 2024년에는 수출이 73%를 차지하는 등 연도별 매출 구조가 가변적임.
주요 고객은 글로벌 다국적 제약사로, 기술 검증을 거쳐 반복 계약으로 이어지는 구조를 구축하고 있으며, 2025년 2분기부터 미국 보스턴 현지 파견 인력을 통한 본격 사업개발을 추진 중임. BCL2 family, 선천면역복합체, STAT3 등 3개 단백질군에 대한 상용화된 바이오마커 분석법을 보유하고, AI 기반 신약 설계로 사업 영역을 확장하고 있음.